Análisis de microbiota fecal en 3 especies de aves de compañía utilizando secuenciación masiva de nueva generación

Alanis López, Cecilia (2015) Análisis de microbiota fecal en 3 especies de aves de compañía utilizando secuenciación masiva de nueva generación. Maestría thesis, Universidad Autónoma de Nuevo León.

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Resumen

Las aves son uno de los grupos de seres vivos más interesantes que habitan en el mundo, ya que presentan rasgos fisiológicos, estrategias de desarrollo y dietas extremadamente complejas, logrando adaptarse a diferentes hábitats del mundo, co-existir y evolucionar a lo largo del tiempo. Sin embargo, estas diferencias podrían derivarse de la selección de ecosistemas microbianos debido a la dieta de un hospedador o a su sistema inmunológico. Del mismo modo, las comunidades microbianas del intestino pueden estar compuestas de microorganismos ambientales pre-adaptados al entorno bioquímico del Tracto Gastrointestinal (TGI), en lugar de los microorganismos que han co-evolucionado con sus hospederos. Teniendo en cuenta dicha variación de la microbiota gastrointestinal con la condición de su hospedero, el estudio del conjunto de bacterias dentro de los animales tiene un alto valor ecológico y un gran impacto en cuestiones evolutivas. Sin embargo, la importancia biológica de la microbiota intestinal en las aves sigue siendo desconocida. Para determinar la composición del ecosistema bacteriano de las aves en este estudio se realizó un método de secuenciación masiva utilizando el gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal a partir de la microbiota fecal de 3 especies de aves de compañía. En el resultado del análisis comparativo de secuencias se encontró una notable diferencia en el porcentaje de especies bacterianas entre las aves de compañía destacando la microbiota fecal de los canarios (Serinus canaria) compuesta en su mayoría por Lactobacillus aviarius (mediana: 74% de todas las secuencias, la mediana de todas las otras muestras: 0.2%). El patógeno Clostridium colinum estaba presente en concentraciones altas sólo en muestras de cacatúas (Nymphicus hollandicus mediana: 21.4%, la mediana de todas las otras muestras: 0.02%). Con este estudio, se sugiere que existen importantes diferencias en los ecosistemas microbianos del TGI entre las aves estudiadas. Al mismo tiempo, esta investigación proporciona información relevante para futuros estudios sobre la secuenciación del gen 16S relacionando los efectos de la edad, la genética, el medio ambiente y la alimentación de las diferentes especies de aves.

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