Homogeneidad genética en mujeres con cáncer de mama en el noreste de México

Calderón Garcidueñas, Ana Laura (2005) Homogeneidad genética en mujeres con cáncer de mama en el noreste de México. Doctorado thesis, Universidad Autónoma de Nuevo León.

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Resumen

Propósito y Método de Estudio: El cáncer de mama (CM) es la segunda neoplasia maligna más frecuente en México y es la primera causa de muerte por neoplasia en mujeres de Nuevo León. Aunque existen estudios en el Noreste de México que han probado homogeneidad genética en población aleatoria con el estudio de grupos sanguíneos, DNAmt y marcadores polimórficos del tipo de D1S80 y HLA-DQAl, es muy importante determinar si existe homogeneidad genética no solo en la población general, sino también en la población con cáncer. En este trabajo se determinó si existe homogeneidad genética en mujeres con cáncer de mama en una muestra de 115 mujeres con CM y 143 individuos de población general. Se utilizaron tres marcadores polimórficos del tipo STRs y se comparó la estructura genética de estas poblaciones seleccionadas versus la estructura genética de un estudio previo en población aleatoria en el Noreste de México. Para la realización de este trabajo se montó y estandarizó la técnica para obtención de DNA, amplificación de los STRs y detección de los polimorfismos mediante electroforesis en gel de poliacrilamida y revelado con plata. Contribuciones y conclusiones: Las frecuencias génicas de los tres STRs para las poblaciones con y sin CM estuvieron en equilibrio de Hardy-Weinberg. Para los 3 STRs (D16S539, D7S820 y D13S317): 1) las heterocigocidades observadas (esperadas) fueron 0.77 (0.78), 0.77 (0.77) y 0.80 (0.80) para CM y 0.76 (0.77), 0.78 (0.78) y 0.81 (0.81) para la población general, 2) las PDs fueron 0.90, 0.91 y 0.92 para CM y 0.89, 0.91 y 0.93 para la población general y 3) las PEs fueron 0.56, 0.55 y 0.61 para CM y 0.55, 0.57 y 0.63 para la población general. Las comparaciones de las frecuencias alélicas y genotípicas entre las poblaciones con y sin CM no fueron significativas. Las contribuciones caucásicas, indígena y africana para la población: 1) CM: 32%, 59% y 9%, 2) General: 45%, 54% y 1%, 3) Hispanos: 44%, 55% y 1% y 4) Honduras: 24%, 59% y 17%. Las comparaciones entre CM, población general e Hispanos no mostraron diferencias significativas entre ellas pero si con la población de Honduras al aplicarse la prueba de Rao. El análisis de componentes principales explicó un 98% de la variabilidad ubicando a las poblaciones en un plano similar, e intermedio a las poblaciones ancestrales caucásicas e indígenas y mínimamente a la africana.. Estos resultados apoyan la hipótesis propuesta en el presente estudio. La demostración de homogeneidad genética en esta población seleccionada con CM indica que esta población es adecuada para 1) realizar estudios de marcadores genéticos asociados con la enfermedad en la búsqueda de genes candidatos y 2) de farmacogenómica. Abstract Purpose and Study Methods : Breast cancer (BC) is the second most frequent Malignant neoplasia in Mexico and the first neoplastic cause of death in women at Nuevo Leon. Although there are studies in the Northeast Mexico that had proved genetic homogeneity in aleatory population using blood groups, DNAmt and polymorphic markers such as D1S80 and HLA-DQA1, it is very important to establish if there is genetic homogeneity not only in general population, but also in cancer population. In this work we determined if there was genetic homogeneity in women with breast cancer in a sample of 115 women with BC and 143 healthy individuals. Three polymorphic STR type markers were used and the genetic structure of the selected population was compared with one of a previous study in aleatory population in Northeast Mexico. The techniques employed included DNA obtainment, STRs amplification, and detection of polymorphisms with polyacrilamide gel electrophoresis and silver staining. Contributions and conclusions: The genetic frequencies of the three STRs for the populations with and without BC were in equilibrium of Hardy-Weinberg. For the 3 STRs (D16S539, D7S820 y D13S317): 1) Observed heterocigocity (expected) were 0.77 (0.78), 0.77 (0.77) and 0.80 (0.80) for BC and 0.76 (0.77), 0.78 (0.78) and 0.81 (0.81) for the general population, 2) The DPs were 0.90, 0.91 and 0.92 for BC and 0.89, 0.91 and 0.93 for general population 3) The EPs were 0.56, 0.55 and 0.61 for BC and 0.55, 0.57 and 0.63 for general population. The comparison of allelic and genotypic frequencies between populations with and without BC was not significant. The Caucasian, Indian and African contributions for the population, were: 1) BC: 32%, 59% y 9%, 2) General: 45%, 54% y 1%, 3) Hispanics: 44%, 55% y 1% y 4) Honduras: 24%, 59% y 17%. Comparisons between BC, general populations and Hispanics did not show significative differences among them, but were evident with the Honduras population with the Rao test. The component analysis explained 98% of the variability, locating the populations in a similar plane, and in the middle way respecting to the Caucasian and Indian ancestries and in minor degree with the African one. These results support the proposed hypothesis in this study. The demonstration of genetic homogeneity in this selected BC population indicates that this population is adequate for: 1) Search BC candidate genes and 2) Research in pharmacogenomics.

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