Caracterización genotípica de aislamientos clínicos de mycobacterium tuberculosis: perfiles de resistencia a antifímicos y mutaciones en genes asociados a resistencia

Flores Treviño, Samantha Maribel (2013) Caracterización genotípica de aislamientos clínicos de mycobacterium tuberculosis: perfiles de resistencia a antifímicos y mutaciones en genes asociados a resistencia. Doctorado thesis, Universidad Autónoma de Nuevo León.

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Resumen

Objetivos: Obtener el perfil de resistencia a antifímicos de aislamientos clínicos de M. tuberculosis, detectar mutaciones asociadas, obtener spoligotipos y determinar su relación filogenética. Material y Métodos: Se incluyeron 105 aislamientos identificados con pruebas fenotípicas y genotípicas. Se determinó su perfil de farmacorresistencia a isoniazida (INH), rifampicina (RIF), estreptomicina (STR) y etambutol (EMB) mediante el método de proporciones y el método de MGIT. Se analizaron los genes asociados a resistencia a INH (katG, inhA y ahpC) y RIF (rpoB), mediante PCR-RFLP y pirosecuenciación. Por último, se genotipificaron mediante spoligotyping. Resultados: El 48.6% de los aislamientos fueron farmacorresistentes (FR), y 19% fueron multifarmacorresistentes (MFR). El 48% de los aislamientos resistentes presentó mutaciones en rpoB, el 14% en katG, el 26% en inhA y el 26% en ahpC. En aislamientos susceptibles a INH se encontró un posible polimorfismo en ahpC (29%). Se detectaron 31 spoligotipos distintos; 47 aislamientos se agruparon en 10 clústers (69%) y 21 aislamientos presentaron patrones únicos. Tres de estos patrones únicos correspondieron a patrones huérfanos en la base de datos, mientras que 1 tipo compartido (SIT) fue recientemente creado (n=2). Los linajes más prevalentes fueron: T (38.2%), Haarlem (17.7%) y Latinoamérica-Mediterráneo (17.7%), seguido de X (7.4%), S (5.9%), África-India del este (EAI, 1/68, 1.5%) y Beijing (1/68, 1.5%). Seis de los aislamientos agrupados fueron MFR (12.8%). SIT406 de la familia Beijing se detectó en un aislamiento MFR. Conclusiones: Se detectaron altos niveles de FR y MFR. La baja frecuencia de mutaciones asociadas a farmacorresistencia junto con el nivel de agrupación indica que hay baja transmisión de clonas de cepas MFR. Los linajes predominantes fueron T, Haarlem y Latinoamérica-Mediterráneo. Se detectó por primera vez en Latinoamérica un genotipo Beijing raro, SIT406, con un fenotipo MFR.

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